Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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