Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1eQ61290 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms