Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc1Q61056 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms