Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbbp4Q60972 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms