Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms