Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf8Q60846 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms