Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SkiQ60698 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms