Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprnQ60673 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms