Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema5bQ60519 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms