Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnajc11Q5U458 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms