Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Zkscan4Q5SZT6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Zkscan4Q5SZT6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Zkscan4Q5SZT6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zkscan4Q5SZT6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Zkscan4Q5SZT6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Zkscan4Q5SZT6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zkscan4Q5SZT6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms