Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AbrQ5SSL4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AbrQ5SSL4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms