Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms