Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf12Q5SPL2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf12Q5SPL2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms