Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms