Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trdv2-2Q5R1A4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms