Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig2Q52KR2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms