Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxn3Q499D0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms