Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cldn34b4Q3V0X2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34b4Q3V0X2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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