Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lrrc43Q3V0L5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Lrrc43Q3V0L5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Lrrc43Q3V0L5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Lrrc43Q3V0L5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Lrrc43Q3V0L5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Lrrc43Q3V0L5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Lrrc43Q3V0L5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Lrrc43Q3V0L5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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Lrrc43Q3V0L5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc43Q3V0L5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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Lrrc43Q3V0L5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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