Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim40Q3UWA4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms