Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Thsd4Q3UTY6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd4Q3UTY6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Thsd4Q3UTY6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Thsd4Q3UTY6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Thsd4Q3UTY6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Thsd4Q3UTY6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Thsd4Q3UTY6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Thsd4Q3UTY6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Thsd4Q3UTY6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Thsd4Q3UTY6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Thsd4Q3UTY6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd4Q3UTY6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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