Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf48Q3US17 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms