Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc190Q3URK1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc190Q3URK1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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