Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ28

Pxdn, Peroxidasin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PxdnQ3UQ28 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PxdnQ3UQ28 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PxdnQ3UQ28 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms