Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPF5

Zc3hav1, Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3hav1Q3UPF5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zc3hav1Q3UPF5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms