Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pin1rt1Q3ULQ2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms