Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CrxosQ3UL53 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxosQ3UL53 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms