Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LchnQ3UHG7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LchnQ3UHG7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms