Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc58Q3UGP9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc58Q3UGP9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms