Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pid1Q3UBG2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms