Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssbp4Q3U4B1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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