Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ulk3Q3U3Q1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ulk3Q3U3Q1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ulk3Q3U3Q1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ulk3Q3U3Q1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ulk3Q3U3Q1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ulk3Q3U3Q1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk3Q3U3Q1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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