Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbq1bQ3U0A6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbq1bQ3U0A6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms