Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiartQ3TQ03 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CiartQ3TQ03 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms