Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccbe1Q3MI99 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccbe1Q3MI99 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccbe1Q3MI99 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccbe1Q3MI99 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccbe1Q3MI99 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccbe1Q3MI99 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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