Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Treml4Q3LRV9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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