Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm1123Q1RME4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1123Q1RME4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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