Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms