Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf3ip1Q149C2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms