Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spatc1Q148B6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Spatc1Q148B6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Spatc1Q148B6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Spatc1Q148B6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Spatc1Q148B6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Spatc1Q148B6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Spatc1Q148B6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Spatc1Q148B6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Spatc1Q148B6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Spatc1Q148B6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spatc1Q148B6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms