Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli2Q0VGT2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms