Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtel1Q0VGM9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms