Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rundc1Q0VDN7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc1Q0VDN7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms