Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms