Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
StumQ0VBF8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
StumQ0VBF8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
StumQ0VBF8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
StumQ0VBF8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
StumQ0VBF8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
StumQ0VBF8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
StumQ0VBF8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
StumQ0VBF8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
StumQ0VBF8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
StumQ0VBF8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
StumQ0VBF8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms