Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs3Q05895 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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