Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sox13Q04891 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms