Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx1Q04742 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms