Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smarcad1Q04692 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms